O projeto Guanamangue quer jogar luz na importância da preservação dos manguezais, aumentando o conhecimento e a gestão ambiental em relação aos manguezais de três unidades de conservação da Baía de Guanabara: APA de Guapi-Mirim, Estação Ecológica da Guanabara e o Parque Natural Municipal.
Os cinco núcleos de atividades do Guanamangue são:
- Estudo do potencial de estoque de carbono mantido pelas florestas do mangue;
- Estudo sobre a andada dos caranguejos;
- Estudo sobre o robalo;
- Turismo de base comunitária;
- Fortalecimento comunitário e educação ambiental.
A realização do Projeto Pesquisa Marinha e Pesqueira é uma medida compensatória estabelecida pelo Termo de Ajustamento de Conduta de responsabilidade da empresa PRIO, conduzido pelo Ministério Público Federal – MPF/RJ.